產(chǎn)品概述:
產(chǎn)品貨號(hào):MAG-MS-GDNA-50,MAG-MS-GDNA-250
產(chǎn)品規(guī)格:50 rxns、250 rxns
運(yùn)輸條件:常溫運(yùn)輸
保存條件:PK Soln 2-8℃保存12個(gè)月,-20℃長(zhǎng)期保存,其它組分室溫保存12個(gè)月。
應(yīng)用范圍:抗凝全血或血液白膜層、唾液、含保存液拭子、干拭子/棉簽、干血斑、動(dòng)物組織、培養(yǎng) 細(xì)胞、FFPE、指甲或頭發(fā)、革蘭氏陰性菌。
產(chǎn)品組分
組分 |
MAG-MS-GDNA-50 |
MAG-MS-GDNA-250 |
MB Mix |
0.75 mL |
3.75 mL |
PK Soln |
1.25mL |
6.25mL |
Buffer ATL*1 |
20 mL |
100 mL |
Buffer AL |
20 mL |
100 mL |
Buffer DW1 |
50 mL |
250 mL |
Buffer DW2 (concentrate)*2 |
15 mL |
75 mL |
Buffer EB |
5 mL |
25 mL |
*注:
1)若使用前Buffer ATL有沉淀,需在56℃下溫育溶解后使用;
2)Buffer DW2為濃縮溶液,使用前請(qǐng)按照瓶身標(biāo)簽提示加入無(wú)水乙醇進(jìn)行稀釋。
產(chǎn)品介紹
本制品適用于從多種類型樣本中提取DNA,如:全血或血液白膜層、唾液、含保存液拭子、干拭子/棉簽、干血斑、動(dòng)物組織、培養(yǎng)細(xì)胞、FFPE等樣本。試劑盒采用了磁性納米顆粒固相核酸富集技術(shù),精選高性能納米磁珠,配合精心研制的Buffer體系組合而成。提取所得的DNA產(chǎn)物可直接用于PCR、qPCR、芯片分析、NGS等各種下游分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。
適用儀器
適用于基于磁轉(zhuǎn)移技術(shù)的32位或96位核酸提取儀。如BIO-DL 32,TIANGEN TGuide S32,TIANLONG NP968-C,Rosetta 96等自動(dòng)化核酸提取儀,也適用于手動(dòng)提取。
操作步驟
一.首次使用前:
1.樣本前處理步驟,若使用水浴鍋進(jìn)行裂解,期間需將內(nèi)容物顛倒混勻2~3次;若使用恒溫振蕩器裂解,建議設(shè)置振蕩速度為1000~1500 rpm;
2. Buffer DW2使用前需按照試劑瓶標(biāo)簽提示加入無(wú)水乙醇進(jìn)行稀釋后使用;
3.建議使用Buffer DW1清洗2次,可改善所得DNA純度。
4.自備試劑:異丙醇(AR)、無(wú)水乙醇(AR)
二.樣本前處理
A. 抗凝全血或血液白膜層
1. 向2 mL離心管中加入25 μL PK Soln。
2. 加入250 μL抗凝全血樣本至上述離心管。
注:禽類抗凝血液,取10~15 μL并加入去離子水補(bǔ)足至250 μL,再進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
3. 加入250 μL Buffer AL,高速渦旋10秒,于70℃振蕩溫浴15分鐘。短暫離心后 冷卻至室溫。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
B. 新鮮唾液、含保存液的唾液或含保存液拭子
1. 向2 mL離心管中加入25 μLPK Soln。
2. 加入300μL新鮮唾液樣本(或唾液/保存液混合液、充分渦旋的拭子/保存液混合液 樣本)至上述離心管。
3. 加入300μL Buffer AL,高速渦旋10秒,于70℃振蕩溫浴15分鐘。短暫離心后 冷卻至室溫。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
C. 干拭子/棉簽樣本
1. 轉(zhuǎn)移采集完細(xì)胞的干拭子(或棉簽)至2 mL離心管中,加入25 μLPK Soln。
2. 加入400 μL Buffer ATL,高速渦旋10秒,于58℃振蕩溫浴30分鐘。
3. 加入400 μL Buffer AL,渦旋混勻,于70℃振蕩溫浴10分鐘,10,000×g離心1分鐘后,吸取600 μL上清液轉(zhuǎn)移至新的2 mL離心管中。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
D. 干血斑(DBS)
1. 轉(zhuǎn)移3~10片3×3 mm尺寸的干血斑(或1~4片6×6 mm尺寸的干血斑)至2 mL離心管中,加入25 μL PK Soln。
2. 加入400 μL Buffer ATL,高速渦旋10秒,于58℃振蕩溫浴30~60分鐘。
注:劇烈振蕩對(duì)干血斑樣本中DNA釋放是有利的,建議在1,500 rpm下進(jìn)行操作,陳舊血卡、動(dòng)物血卡、過(guò)量血卡可適當(dāng)延長(zhǎng)裂解時(shí)間。
3. 加入400 μL Buffer AL,渦旋混勻,于70℃振蕩溫浴10~15分鐘。10,000×g離心1分鐘后,吸取600 μL上清液轉(zhuǎn)移至新的2 mL離心管中。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
E. 動(dòng)物組織
1. 轉(zhuǎn)移小于30 mg動(dòng)物組織至2 mL離心管中,加入25 μL PK Soln。
2. 加入300μL Buffer ATL,高速渦旋10秒。58℃振蕩溫浴30~60分鐘或延長(zhǎng)時(shí)間至完全消化樣本。(如果需要去除RNA,加入2~4 μL RNaseA(100 mg/mL)室溫放置10分鐘以降解RNA)。
注1:對(duì)于不易消化的組織樣本,可延長(zhǎng)消化時(shí)間至消化完全;若存在長(zhǎng)時(shí)間未能消化完全的物質(zhì),可10,000×g離心1分鐘,然后轉(zhuǎn)移上清液至新的2 mL離心管中。
注2:對(duì)于骨頭和牙齒,需要先液氮研磨成粉末,取100 mg粉末進(jìn)行實(shí)驗(yàn),需延長(zhǎng)消化時(shí)間。
3. 加入300μL Buffer AL,渦旋10秒混合均勻。
注:對(duì)于不易裂解的組織樣本且希望獲得更好的DNA質(zhì)量,需繼續(xù)在70℃下裂解10分鐘;對(duì)于組織量少且較易裂解的組織樣本,無(wú)需該70℃裂解步驟。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
F. 培養(yǎng)細(xì)胞
1. 取一定量的細(xì)胞樣本(<5×106 cells)置于2 mL離心管中,1,000×g離心5分鐘收集細(xì)胞,小心棄去上清液。
2. 加入25 μL PK Soln和300μL PBS緩沖液,渦旋打散細(xì)胞。
3. 加入300μL Buffer AL,渦旋10秒,于70℃振蕩溫浴15分鐘。短暫離心后,冷卻至室溫。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
G. FFPE
1. 將2~8張石蠟切片(厚度5~10 μm)轉(zhuǎn)入2 mL離心管中,用二甲苯或代替物脫除石蠟,然后用無(wú)水乙醇清洗干凈,烘干。
2. 加入25 μL PK Soln和300μL Buffer ATL,高速渦旋10秒,于58℃振蕩溫浴30~60分鐘或至樣本完全裂解。
3. 將離心管置于90℃下溫浴60分鐘(此步驟無(wú)需振蕩)。短暫離心后冷卻至室溫。
4. 向離心管中加入300μL Buffer AL、350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
H. 指甲、頭發(fā)和羽毛
1. 轉(zhuǎn)移10~25 mg指甲、頭發(fā)或羽毛樣本至2 mL離心管中。
注:指甲樣本盡量剪成小片;頭發(fā)樣本從發(fā)根部剪下0.5~1 cm數(shù)根;羽毛樣本剪下1~5 cm長(zhǎng)并剪短;精斑樣本?。?.5 cm2;精液樣本吸取100 μL。
2. 加入25 μL PK Soln、20 μL 1M DTT和300μL Buffer ATL,高速渦旋10秒后,于58℃振蕩溫浴30~60分鐘或延長(zhǎng)時(shí)間至完全消化樣本。
注:對(duì)于毛發(fā)樣本,通常1小時(shí)即可達(dá)到基本消化;對(duì)于指甲樣本,無(wú)需等待指甲完全消化,通常1~6小時(shí)后即可吸取消化液進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn);精斑&精液樣本至少消化1小時(shí)。
3. 加入300μL Buffer AL,渦旋10秒。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix ,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
I. 革蘭氏陰性菌
1. 取一定量的細(xì)菌培養(yǎng)液1~5 mL(<2×109 cells)10,000×g離心1分鐘,小心棄去上清液。
2. 加入25 μL PK Soln和300μL Buffer ATL至上述離心管。渦旋10秒后,于58℃振蕩溫浴30分鐘。
3. 加入300 μL Buffer AL,渦旋10秒。
注:對(duì)于大量細(xì)菌,可繼續(xù)在70℃下裂解10分鐘;對(duì)于少量細(xì)菌,則無(wú)需該70℃裂解步驟。
4. 向離心管中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix,渦旋振蕩5~10分鐘。按【純化步驟】繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)操作。
三.純化步驟:手動(dòng)法
5. 短暫離心,將離心管內(nèi)液體收集至底部,然后將離心管置于磁力架上靜置30秒。
待磁珠完全吸附后,用移液器吸棄管內(nèi)液體。
6. 向離心管中加入700 μL Buffer DW1,1,000 rpm渦旋振蕩2~3分鐘,磁性分離,吸棄上清液。
注:如對(duì)核酸產(chǎn)物純度要求較高,該步清洗方案可變更為使用500 μL Buffer DW1清洗2次,可獲得更優(yōu)的A260/280和A260/230數(shù)值。
7. 向離心管中加入700 μL Buffer DW2(已用乙醇稀釋),1,000 rpm渦旋振蕩2~3分鐘,磁性分離,吸棄上清液。
8. 重復(fù)上述步驟7一次。
9. 將離心管繼續(xù)保持在磁力架上,放入45~50℃烘箱中,干燥約10分鐘至無(wú)明顯乙醇?xì)馕叮ㄒ部墒覝亓栏?,但需要更長(zhǎng)時(shí)間)。
10. 揮發(fā)除醇結(jié)束后,向離心管中加入50~100 μL Buffer EB,吹散或振散磁珠,58℃振蕩溫浴5~10分鐘。磁性分離,將洗脫液轉(zhuǎn)移至另一干凈離心管中,得DNA產(chǎn)物,保存于-20℃。
四.純化步驟: 96位核酸提取儀
1. 將Sample Plate中加入350 μL異丙醇和15 μL MB Mix(可預(yù)先混合);
2. 在Sample Plate中加入相應(yīng)體積的不同樣本的裂解上清液;
3. 將96位磁棒套放入到Wash 3 Plate中(必須準(zhǔn)確放入,否則可能損壞磁棒套。此步驟為針對(duì)King Fisher Flex,若使用其它品牌儀器請(qǐng)做相應(yīng)調(diào)整)。
4. 將試劑板按對(duì)應(yīng)順序放入核酸提取儀中,運(yùn)行程序。
5. 程序運(yùn)行完畢,轉(zhuǎn)移Elute Plate中DNA至新離心管中,提取過(guò)程結(jié)束。
注:長(zhǎng)時(shí)間保存建議將DNA產(chǎn)物保存于-20℃環(huán)境。